Page 57 - Kralj-Fišer, Simona, 2024. Od genov do vedenja in naprej. Koper: Založba Univerze na Primorskem.

od genov do vedenja

Slika 4.6: Tri izoformne beljakovin, nastale iz istega gena kot posledica alternativnega spajanja
Vir: https://en.wikipedia.org/wiki/Alternative_splicing#/media/File:DNA_alternative_splicing.gif.
Protein A vključuje vse eksone, pri čemer proteina B in C nastaneta brez določenih eksonov.

katerih izražanje se je spremenilo zaradi bolezni, primerjamo zdrave in obolele;
lahko zasledujemo, kdaj, koliko in v katerih tkivih se določeni geni izražajo. 9
Raziskave transkriptomike ustvarjajo velike količine podatkov, ki imajo potencial-
no uporabo, ki daleč presega prvotne cilje. Kot taki se neobdelani ali obdelani po-
datki lahko shranijo v javne zbirke podatkov. Npr., od leta 2018 je podatkovna baza
Gene Expression Omnibus zbrala na milijone podatkov. Obstaja še več drugih po-
dobnih podatkovnih baz. Na tem področju so intenzivne raziskave o spremembah
10
ekspresije genov pri različnih oblikah raka.
Naj omenimo, da pri miših izražanje genov opazujejo celo med izvajanjem vede-
nja. Tako pri projektu Genes to Cognition (G2C)(http://www.genes2cognition.org

/about) raziskujejo ekspresijo genov med kognitivnimi testi. Podatke o ekspresiji
genov uporabljajo za razumevanje kognicije in motenj kognicije na molekularni,
celični in organizemski ravni.

Primer baz traskriptomskih podatkov najdete v preglednici 5 v Lowe idr. (2017).

4.3 Proteom
Nadaljnja raven analize je proteom, tj. celoten sklop proteinov, ki so v danem tre-
nutku izraženi na ravni celice, tkiva ali organizma. Proteom je mnogo komplek-
snejši kot genom (1.000.000 različnih proteinov) (Slika 4.7).
Večja kompleksnost proteoma je povezana:

9 Več v Adams (2008a) in »Transcriptomics Technologies« (2023).
10 Več v Contractor Security Guidance (b. l.) in na http://fantom.gsc.riken.jp/4/

57